Os dois vocábulos são aceitos. A preferência é que decide. Mas, quando se referir ao adjetivo, só há percentual, que é derivado de percentagem. Porcentagem não tem derivados.
Quanto à concordância, o verbo pode concordar com o número ou com o nome.
Exemplo: 50% do público cantou (concorda com público) ou cantaram (concorda com 50. Um por cento dos presentes saiu(concorda com um) ou saíram(concorda com presentes).
Observe, porém, esta construção: 30% das pessoas prefere o azul. Quanto à regra de que a concordância pode-se fazer com o número ou o nome que o acompanha, veja que nesse caso só o plural é aceitável, porque se trata de plural, tanto do número quanto do nome.
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Deusirene Amorim – Revisora
Fonte: SQUARISI, Dad. Português com Humor. 6. ed. – São Paulo: Contexto, 2002